Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1SQ13698 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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