Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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