Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BNIP1Q12981 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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BNIP1Q12981 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BNIP1Q12981 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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