Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHD3Q12873 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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