Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DSC2Q02487 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms