Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VBP1P61758 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VBP1P61758 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms