Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP7P55210 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP7P55210 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP7P55210 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP7P55210 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP7P55210 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP7P55210 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP7P55210 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP7P55210 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP7P55210 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP7P55210 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP7P55210 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP7P55210 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP7P55210 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP7P55210 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP7P55210 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP7P55210 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP7P55210 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP7P55210 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP7P55210 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP7P55210 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP7P55210 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP7P55210 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP7P55210 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP7P55210 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms