Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
SMARCA2P51531 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA2P51531 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms