Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL15A1P39059 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL15A1P39059 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms