Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA10P31260 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms