Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM4SF1P30408 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms