Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRMP28827 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRMP28827 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
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