Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms