Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APCP25054 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APCP25054 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APCP25054 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCP25054 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCP25054 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCP25054 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCP25054 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCP25054 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCP25054 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCP25054 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCP25054 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCP25054 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCP25054 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCP25054 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCP25054 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCP25054 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCP25054 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCP25054 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APCP25054 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APCP25054 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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