Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRHP20396 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRHP20396 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRHP20396 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRHP20396 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRHP20396 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRHP20396 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRHP20396 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRHP20396 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRHP20396 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRHP20396 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRHP20396 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRHP20396 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRHP20396 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRHP20396 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRHP20396 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRHP20396 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRHP20396 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRHP20396 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRHP20396 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRHP20396 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRHP20396 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRHP20396 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRHP20396 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRHP20396 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRHP20396 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRHP20396 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRHP20396 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRHP20396 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRHP20396 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRHP20396 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRHP20396 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRHP20396 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRHP20396 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRHP20396 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRHP20396 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRHP20396 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRHP20396 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRHP20396 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRHP20396 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRHP20396 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRHP20396 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRHP20396 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRHP20396 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRHP20396 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRHP20396 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRHP20396 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRHP20396 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRHP20396 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRHP20396 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRHP20396 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRHP20396 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRHP20396 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRHP20396 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRHP20396 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRHP20396 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRHP20396 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRHP20396 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRHP20396 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRHP20396 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRHP20396 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRHP20396 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRHP20396 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRHP20396 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRHP20396 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRHP20396 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRHP20396 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRHP20396 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRHP20396 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRHP20396 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRHP20396 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRHP20396 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRHP20396 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRHP20396 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms