Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD53P19397 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD53P19397 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD53P19397 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD53P19397 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD53P19397 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD53P19397 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms