Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CREB1P16220 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CREB1P16220 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CREB1P16220 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CREB1P16220 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CREB1P16220 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CREB1P16220 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CREB1P16220 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CREB1P16220 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CREB1P16220 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CREB1P16220 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CREB1P16220 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CREB1P16220 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB1P16220 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB1P16220 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms