Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms