Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms