Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCCAP05165 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCCAP05165 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCCAP05165 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCCAP05165 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCCAP05165 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCCAP05165 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCCAP05165 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCCAP05165 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCCAP05165 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCCAP05165 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCCAP05165 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCCAP05165 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCCAP05165 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCCAP05165 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCCAP05165 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCCAP05165 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCCAP05165 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCCAP05165 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCCAP05165 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCCAP05165 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCCAP05165 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCCAP05165 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCCAP05165 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCCAP05165 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCCAP05165 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCCAP05165 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms