Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF1O95521 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms