Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP19O94966 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP19O94966 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP19O94966 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP19O94966 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP19O94966 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP19O94966 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP19O94966 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP19O94966 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP19O94966 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP19O94966 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP19O94966 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP19O94966 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP19O94966 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP19O94966 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP19O94966 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP19O94966 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP19O94966 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP19O94966 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP19O94966 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP19O94966 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP19O94966 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP19O94966 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP19O94966 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP19O94966 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP19O94966 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP19O94966 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP19O94966 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP19O94966 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP19O94966 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP19O94966 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP19O94966 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP19O94966 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP19O94966 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP19O94966 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP19O94966 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP19O94966 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms