Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECM2O94769 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECM2O94769 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECM2O94769 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM2O94769 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM2O94769 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM2O94769 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM2O94769 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM2O94769 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM2O94769 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM2O94769 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM2O94769 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM2O94769 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM2O94769 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECM2O94769 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms