Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DENRO43583 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DENRO43583 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DENRO43583 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms