Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTIFO43310 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTIFO43310 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTIFO43310 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTIFO43310 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
CTIFO43310 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTIFO43310 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTIFO43310 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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