Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNMO15061 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNMO15061 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNMO15061 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNMO15061 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNMO15061 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNMO15061 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNMO15061 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNMO15061 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNMO15061 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNMO15061 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNMO15061 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNMO15061 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNMO15061 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNMO15061 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNMO15061 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNMO15061 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms