Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms