Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVV-2B6SEH9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVV-2B6SEH9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms