Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFGEF2Q9Y6D5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms