Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms