Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNMA3Q9UL41 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNMA3Q9UL41 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms