Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP68Q9UHB9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRP68Q9UHB9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRP68Q9UHB9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRP68Q9UHB9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRP68Q9UHB9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms