Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4L1Q9NU39 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms