Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms