Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKRIP1Q9H875 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKRIP1Q9H875 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms