Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D2

CEP295, Centrosomal protein of 295 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295Q9C0D2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP295Q9C0D2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms