Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP1Q9C000 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms