Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAPERQ9BY12 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms