Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms