Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms