Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms