Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC59Q96AG4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC59Q96AG4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC59Q96AG4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC59Q96AG4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC59Q96AG4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC59Q96AG4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms