Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms