Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TOPBP1Q92547 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TOPBP1Q92547 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms