Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO7Q8WWI1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms