Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX54Q8TDD1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX54Q8TDD1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms