Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF248Q8NDW4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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