Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms