Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC191Q8NCU4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC191Q8NCU4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms