Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00299Q6ZSB3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms